小生物の素材は龍脈からくりの手飼いの籠、手飼いの柵を使用することで入手できます。
| 小生物名 | 生息地 | 懐き素材 |
| コノミリス | 春霞の古道 | 飼い獣の実 |
| サクラノテントウ | 春霞の古道 | 星桜 |
| ハゴロモツバメ | 春霞の古道 | 飼い獣の尾羽 |
| キンカヅル | 春霞の古道 | 菊花の羽 |
| ハナツキデンデン | 春霞の古道 | 飼い獣の輝殻 |
| ゼンマイヤモリ | 春霞の古道 | 棘巻きぜんまい |
| タマノエニシキ | 春霞の古道 | 飼い獣の実 |
| ホウショウウオ | 春霞の古道 | なし |
| コウラトト | 春霞の古道 | なし |
| コワタリズマイ | 夏木立の島 | 飼い獣の輝殻 |
| ハタラキゼミ | 夏木立の島 | 甘露蜜 黄金蜜 |
| ベッコウカブト | 夏木立の島 | さいかち蜜 |
| ハスツバメ | 夏木立の島 | 飼い獣の尾羽 |
| キンズヤモリ | 夏木立の島 | 飼い獣の緋胞子 |
| ホウライグリ | 夏木立の島 | 飼い獣の実 |
| イワノトト | 夏木立の島 | なし |
| ハナハコビ | 秋昏の峡谷 | いなり葛󠄀 |
| イガボウズ | 秋昏の峡谷 | 栗もどき |
| ヒボシテントウ | 秋昏の峡谷 | 飼い獣の実 |
| カラヤンマ | 秋昏の峡谷 | 秋わさび |
| チョウチンナマズ | 秋昏の峡谷 | なし |
| ツキノタマ | 冬塞ぎの孤城 | 雪の葉 |
| ユキミリス | 冬塞ぎの孤城 | 飼い獣の実 |
| タマハナムシ | 冬塞ぎの孤城 | 雪花の結晶 |
| ポンフクロウ | 冬塞ぎの孤城 | 満フク柚子 |
| カンナヅル | 冬塞ぎの孤城 | 菊花の羽 |